Είναι θεμελιωμένος πάνω σε προϋπάρχον κτίσμα Βυζαντινής περιόδου. Το μοναστήρι, βάσει των αρχειακών πηγών, παρουσίαζε συνεχή ζωή επί οκτώ αιώνες και αποτελούσε ένα από τα πέντε πιο σημαντικά μοναστήρια της Λευκάδας με πνευματική ζωή και ακτινοβολία.
Κατά των 18ο αιώνα η Μονή της Κόκκινης Εκκλησιάς, έφτασε στην ακμή της. Αξίζει να σημειωθεί ότι από την Ιερά Μονή Κόκκινης Εκκλησιάς, αναδείχθηκε σε Αρχιεπίσκοπο Λευκάδος ο Θεοφάνης Δανιάς ένας από τους αξιώτερους Ηγουμένούς της, ο οποίος φρόντησε για την αναστήλωσή της μετά από τον καταστροφικό σεισμό του 1704. Σήμερα μετά τόσες δεκαετίες παρακμής, η Ιερά Μονή της Φανερωμένης απευθύνει έκκληση προς όλους να ενισχύσουν την προσπάθεια της Ιεράς Μονής Κόκκινης Εκκλησιάς.
Για τις ανάγκες τις Μονής έχει ανοιχτεί ειδικός λογαριασμός στην Τράπεζα Πειραιώς με αριθμό:(ΙΒΑΝ) GR
24 0172 4540 0054 5409 2200 531
